Per spegnere un motore diesel in marcia le strade sono due: o si interrompe la mandata del gasolio, o si blocca meccanicamente la rotazione dello stesso.
Escluderei apriori questa seconda ipotesi, altrimenti saresti ancora piantato lì dove si è fermata la vettura, quindi non resta che capire quale sia la causa per la quale non arriva gasolio al motore...
...E ti pare facile!
Sei assolutamente sicuro che accada casualmente, che non ci sia uno schema, o un demominatore comune ai singoli eventi?
Di getto ti direi di far verificare il corretto funzionamento delle pompe di pescaggio e di alta pressione del gasolio, un principio di grippaggio della pompa di alta ad esempio potrebbe causare random il bloccaggio della stassa, per poi riprendere a funzionare in maniera apparentemente regolare quando dopo quelche minuto la temperatura della stessa scende leggermente, ma tra questa fase e il blocco completo della pompa solitamente non ci passa molto, a te quante volte è già successo e con che frequenza?
Altra possibile causa è da cercare negli iniettori o più probabilmente nell' unità che ne controlla l' azionamento, ancheperchè dubito che tutti e quattro si vadano a bloccare meccanicamente tutti insieme nello stasso istante e per lo stesso intervallo di tempo per poi ripartire all' unisono.
Il corpo farfallato (se presente) è pulito, funziona regolarmente, se per qualche oscuro motivo, credo più di natura elettronica la farfalla si chiudesse il motore soffocherebbe, e se all' accensione questa restasse chiusa non ripartiresti.
Il brutto è che di controlli a basso costo da fare non ce ne sono granchè, prova a far dare una spruzzata di pulitore per contatti a i connettori di iniettori, sensori vari (giri, pressioni, temperature, centralina, egr, farfalla, pompa mandata carburante) l' ideale sarebbe come già ti ho detto trovare un denominatore comune per riuscire a replicare il problema con meccanico presente e lettore obd connesso, in maniera tale da cogliere sul fatto l' eventuale componente elettronico responsabile, o interrogare l' eventuale sensore deputato a rilevare il corretto funzionamento di qualche componente meccanico.
Che dire ti auguro tanta buona fortuna!